6.1 Contar palabras, tuberías & permisos¶

Autora: Alejandra Rougon

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🔍 Objetivos de aprendizaje¶

Después de completar esta lección aprenderás a:

Contar caracteres, palabras y líneas
Crear tuberías (pipelines)
Cambiar los permisos

`wc`¶

El comando wc que viene de word count cuenta caracteres, palabras y líneas

$ more amounts.txt
10
50
20
30

$ wc amounts.txt
 4  4 12 amounts.txt

Los números significan cantidad de líneas, palabras y caracteres, respectivamente. Cuatro líneas, cuatro palabras y … espera! ¿Por qué obtenemos 12 caracteres si sólo podemos ver 8? Esto es porque la el cambio de una nueva línea es también un caracter 👆 Puedes especificar líneas con -l, palabras con -w y caracteres con -c.

$ wc -l amounts.txt
 4 amounts.txt

Tuberías `|`¶

Muchas veces podrías querer usar la salida de un comando como entrada de otro comando. A eso se le llama pipeline o tubería y podemos hacerlo con la barra vertical también llamada pipe |.

Ahora imprime las líneas que contengan la letra e en el archivo allfruits en orden alfabético. Así es que primero tienes que encontrar las líneas con grep y luego ordenarlas alfabéticamente con sort. Recuerda que allfruits está en el directorio Documents así es que tienes que cambiarte de directorio o escribir la ruta al archivo.

$ grep 'e' /root/sandbox/Documents/allfruits
pear
orange
melon

Si quieres agregar la salida anterior como entrada del comando sort agrega |y luego sort.

$ grep 'e' /root/sandbox/Documents/allfruits | sort
melon
orange
pear

El símbolo | tomará la salida de un comando y la usará en el siguiente comando. Pero qué tal si quieres simplemente ejecutar dos comandos diferentes? Por ejemplo, cambiar de directorio y luego buscar una cadena dentro de un archivo. En ese caso puedes usar un punto y coma ;

Ahora vamos a encontrar ¿cuántos caracteres contienen las palabras que tienen una p en el archivo toygenes.txt que está en el directorio Practice. Así es que primero ve al directorio Practice, luego busca las líneas con la letra pcon grep y toma la salida como entrada de cut para seleccionar sólo la columna que contiene las palabras y luego cuenta los caracteres con wc.

$ cd Practice ; grep 'p' toygenes.txt | cut -f 1 | wc -c
6

En efecto, la palabra apple contiene 5 letras y es la única palabra que contiene una p. Esto será muy útil cuando empecemos a minar datos biológicos.

`chmod`¶

En sistemas UNIX y derivados de UNIX todos los archivos y directorios pueden tener diferentes permisos para el usuario [dueño del archivo] u, el grupo [usuarios específicos asignados por el administrador] g, para los otros [cualquier otra persona] o para todos all [usuario, grupo y otros]. Esto te permite proteger tus archivos hasta de ti mismo.

Los diferentes permisos son reading [lectura] r, writing [escritura] w, y executing [ejecución] x.

Para ver los permisos de tus archivos y directorios en el directorio Documents, cambia de directorio de trabajo cd /root/sandbox/Documents y luego teclea ls -l

$ ls -l
total 5
drwxr-xr-x 2 root root  2 Apr 10 21:35 Genomes/
drwxr-xr-x 2 root root  6 Apr 24 18:22 Practice/
-rw-r--r-- 1 root root 87 Apr 24 17:02 Readme.copy
-rw-r--r-- 1 root root 64 Apr 23 21:03 Readme.txt
-rw-r--r-- 1 root root 31 Apr 24 20:26 allfruits
-rw-r--r-- 1 root root 70 Apr 23 14:49 contents.txt
-rw-r--r-- 1 root root 31 Apr 23 20:52 fruitall.copy
-rw-r--r-- 1 root root 31 Apr 23 20:47 new_fruitall

Puedes ver cómo los permisos están distribuidos en diferentes posiciones en la siguiente imagen.

La primera posición indica si es un archivo o un directorio, la siguientes tres posiciones pertenecen al usuario [dueño]. Si ella/el tiene permisos de lectura, escritura y ejecución verás rwx si alguno de esos permisos no está disponible, estará representado con un -. Las tres posiciones de en medio representan los permisos del grupo, y las últimas tres representan a los otros [los permisos de cualquier otra persona].

Existen dos maneras de cambiar los permisos. Una es a través de caracteres y la otra es a través de números, llamada el modo octal.

Modo de caracteres¶

En este modo puedes cambiar los permisos con símbolos. Agrega +, elimina -, especifica un permiso =. Por ejemplo:

chmod +r myfile.txt agrega permisos de read [lectura] a todos
chmod g-w myfile.txt elimina permisos de write [escritura] al groupo
chmod u+x myfile.txt agrega permisos de execute [ejecución] al usuario
chmod u=rw, go= myfile.txt agrega permisos de read & write [lectura y escritura] al usuario and elimina read, write & execute al grupo y a los otros

Modo octal¶

En el modo octal cada combinación de permisos representa un número.

Número	Binario	Lectura/read [r]	Escritura/write [w]	Ejecución/Execute (x)
0	000	❌	❌	❌
1	001	❌	❌	👍
2	010	❌	👍	❌
3	011	❌	👍	👍
4	100	👍	❌	❌
5	101	👍	❌	👍
6	110	👍	👍	❌
7	111	👍	👍	👍

Los permisos serán asignados por el número en la posición correspondiente.

chmod 777 myfile.txt dará permisos a todos
chmod 766 myfile.txt dará todos los permisos [lectura, escritura y ejecución] al usuario y permisos de lectura y escritura al groupo y a los otros
chmod 635 myfile.txt da permisos de lectura y escritura al usuario, escritura y ejecución al grupo, y lectura y ejecución a los otros.
chmod 444 myfile.txt permite a todos leer el archivo per elimina permisos de lectura y ejecución. Esto es muy útil en bioinformática para proteger los archivos crudos de modificación no intencional, aún de ti mismo.

Ahora vamos a ver los permisos del archivo allfruits y cambiarlos para darle todos los permisos a todos. Después verifica que se hayan cambiado los permisos correctamente.

$ ls -l allfruits
-rw-r--r-- 1 root root 31 Apr 24 20:26 allfruits
$ chmod 777 allfruits
$ ls -l allfruits
-rwxrwxrwx 1 root root 31 Apr 24 20:26 allfruits*

El asterisco aparece en algunas configuraciones de ls para indicar que es un archivo ejecutable.

🔑 En esta lección has aprendido a:

Contar caracteres, palabras y líneas con wc
Crear tuberías con |
Cambiar permisos con chmod

Plants & Python